>
Dersin Adı Dersin Kodu Dersin Türü Dersin Düzeyi Dersin Yılı Dersin Verildiği Dönem AKTS Kredisi
Biyoinformatik BIO529 Seçmeli Yüksek lisans 1 Bahar 8

Öğretim Elemanı Adı

Prof. Dr. Halim Aytekin ERGÜL

Dersin Öğrenme Kazanımları

1) DNA ve gen veri bankaları, erişimi ve kullanımı
2) Biyoinformatikte internet üzerinden (online) erişilen programlar ve kullanımları
3) DNA dizi dönüştürücüler
4) Primer dizayn etme programları
5) DNA dizilerini hizalama (alignment)
6) BLAST programı ile dizi benzerliklerini araştırma
7) Mikroarray uygulamaları
8) DNA dizi analizinde kullanılan istatistiksel yöntemler ve programlar
9) ara sınav
10) Arlequin
11) DnaSP
12) Phylip
13) MEGA
14) SplitsTree
15) Bioedit
16) Final

Program Yeterliliği İlişkisi

  Program Yeterlilikleri
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29
Öğrenme Kazanımları
1 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek           Yüksek     Yüksek   Düşük Düşük
2 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek           Yüksek     Yüksek   Düşük Düşük
3 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
4 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
5 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
6 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
7 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
8 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
9 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
10 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
11 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
12 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
13 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
14 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
15 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük
16 Düşük                   Orta Yüksek         Yüksek         Yüksek       Yüksek   Düşük Düşük

Eğitim Şekli

Yüz Yüze

Ön Koşullar, Diğer Koşullar

Yok

Önerilen Destekleyici Dersler

Genetik, Moleküler Biyoloji, Biyoteknoloji

Dersin İçeriği

DNA ve gen veri bankaları, erişimi ve kullanımı, Biyoinformatikte internet üzerinden (online) erişilen programlar ve kullanımları: DNA dizi dönüştürücüler, primer dizayn etme programları, DNA dizilerini hizalama (alignment), BLAST programı ile dizi benzerliklerini araştırma, Mikroarray uygulamaları. DNA dizi analizinde kullanılan istatistiksel yöntemler ve programlar: Bioedit, Arlequin, DnaSP, Phylip, MEGA, SplitsTree

Haftalık Ders İzlencesi

1) DNA ve gen veri bankaları
2) DNA ve gen veri bankalarına erişimi ve kullanımı
3) Biyoinformatikte internet üzerinden (online) erişilen programlar ve kullanımları:
4) DNA dizi dönüştürücüler
5) primer dizayn etme programları
6) DNA dizilerini hizalama (alignment),
7) ara sınav
8) Ara sınav/Değerlendirme
9) Mikroarray uygulamaları
10) Bioedit,
11) Arlequin
12) DnaSP
13) Phylip
14) MEGA
15) SplitsTree
16) Yarıyıl sonu sınavı

Önerilen/İstenen Ders Kaynakları

Planlanan Öğrenim Faaliyetleri Ve Eğitim Yöntemi

1) Anlatım
2) Tartışma
3) Gösteri
4) Grup Çalışması
5) Problem Çözme


Değerlendirme Yöntemi ve Ölçütleri

Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarıya Oranı

40%

 

Sayı

Yüzde

Yarıyıl İçi Çalışmaları

Ödev

1

60%

Ara Sınav

1

40%

 

Yarıyıl Sonu Sınavının Başarıya Oranı

60%

Toplam

100%

Dersin Eğitim Dili

Türkçe

Mesleki Uygulama

İstenmemekte