Kocaeli Üniversitesi / Avrupa Kredi Transfer Sistemi (AKTS)

Dersin Adı	Dersin Kodu	Dersin Türü	Dersin Düzeyi	Dersin Yılı	Dersin Verildiği Dönem	AKTS Kredisi
Moleküler Mikrobiyolojinin Temel Prensipleri	MKB101	Seçmeli	Yüksek lisans	1	Güz	5

Öğretim Elemanı Adı

Prof. Dr. Aynur KARADENİZLİ
Prof. Dr. Fetiye KOLAYLI

Dersin Öğrenme Kazanımları
Program Yeterliliği İlişkisi

Dersin Öğrenme Kazanımları

1) Prokaryotlarda DNA ve RNA yapısını öğrenmek
2) PCR prensiplerini ve işlemi bilmek
3) Prokaryotlarda DNA/RNA izolasyon metodlarını bilmek
4) Enfeksiyon HAstalıkları tanısında PCR metodunu uygulayabilmek
5) Farklı PCR tekniklerini bilmek
6) In Situ Hibridizasyon metodlarını bilmek
7) Moleküler mikrobiyolojide tiplendirme metodları
8) KLonlama prosedürünü bilmek

Program Yeterliliği İlişkisi

		Program Yeterlilikleri
		1	2	3	4	5
Öğrenme Kazanımları
	1	Yüksek	Orta	Orta	Orta	Orta
	2	Yüksek	Orta	Yüksek	Orta	Orta
	3	Yüksek	Orta	Orta	Orta	Orta
	4	Yüksek	Düşük	Yüksek	Orta	Orta
	5	Düşük	Düşük	Düşük	Düşük	Düşük
	6	Orta	Orta	Düşük	Düşük	Düşük
	7	Orta	Orta	Orta	Orta	Orta
	8	Orta	Orta	Orta	Orta	Orta

Eğitim Şekli

Yüz Yüze

Ön Koşullar, Diğer Koşullar

Yok

Önerilen Destekleyici Dersler

Dersin İçeriği

1. Moleküler metodların tarihçesi 2. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) • Prensibi • Mikrobiyolojide PCR kullanımı • DNA/RNA izolasyonu • Ana karışım içeriği • Isı döngüsü • Kontaminasyon • Klasik PCR ile ürün büyüklüğünün saptanması • Jel boyalar • PCR işlemlerinin optimizasyonu • PCR inhibitorlerinin sınırlanması-kontrolü 3. PCR sonuçlarının yorumlanması 4. Real Time PCR metodları 5. Moleküler mikrobiyolojide tiplendirme metodları • Poliakrilamid jel elektroforezi (PAGE) • PCR-temelli metodlar (AP-PCR, Rep-PCR, MVLA, AFLP, PCR-RFLP) • PFGE, • Sekanslama 6. PCR dışı moleküler metodlar • Signal amplifikasyon teknikleri • Target amplifikasyon sistemleri (PCR dışındaki) • Transkripsiyon amplifikasyon metodları • Strand displacement amplifikasyon (SDA) • Prob amplifikasyon teknikleri

Haftalık Ders İzlencesi

1) Prokaryotlarda DNA ve RNA
2) Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve mikrobiyolojide kullanımı
3) Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve mikrobiyolojide kullanımı
4) Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve mikrobiyolojide kullanımı
5) Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve mikrobiyolojide kullanımı
6) Enfeksiyon Hastalıkları tanısında PCR metodunun uygulanması
7) PCR temelli teknikler
8) Ara sınav/Deg?erlendirme
9) In-situ hibridizasyon metodları
10) Moleku?ler mikrobiyolojide tiplendirme metodları
11) Moleku?ler mikrobiyolojide tiplendirme metodları
12) Moleku?ler mikrobiyolojide tiplendirme metodları
13) PCR laboratuvarında kontaminasyon
14) Nozokomiyal patojenlerin moleku?ler metodlarla saptanması
15) Moleku?ler metodların avantajları ve dezavantajları
16) Final Sınavı

Önerilen/İstenen Ders Kaynakları

1- Koneman’s Color Atlas and Textbook of Diagnostic Microbiology

Planlanan Öğrenim Faaliyetleri Ve Eğitim Yöntemi

1) Anlatım
2) Soru-Cevap
3) Laboratuvar/Çalıştay

Değerlendirme Yöntemi ve Ölçütleri

Ara Sınav Notunun Başarıya Oranı	30%
Yarıyıl Sonu Sınavının Başarıya Oranı	70%
Toplam	100%

Dersin Eğitim Dili

Türkçe

Mesleki Uygulama

İstenmemekte

Moleküler Mikrobiyolojinin Temel Prensipleri

Mikrobiyoloji

Sağlık Bilimleri Enstitüsü

Yüksek lisans