Moleküler Biyolojide İleri Araştırma Yöntemleri

Eğitim Şekli

Yüz Yüze

Ön Koşullar, Diğer Koşullar

Yok

Önerilen Destekleyici Dersler

Tıbbi Genetik

Dersin İçeriği

Genomic DNA’nın karakterizasyonu, gen transkriptlerinin izolasyonu ve karakterizasyonu, Polimeraz Zincir Reaksiyonu ve uygulamaları, klonlanan genlerin ekspresyonu ve trasgenik multiselüler organizmaların yapılımı.

Haftalık Ders İzlencesi

1) Makromolekül olan RNA ve proteinlerin analiz yöntemlerinde kullanılmak üzere gerekli solüsyon ve tamponların hazırlanması
2) Makromolekül RNA'nın izolasyon tipleri ve analiz yöntemleri; Bitkilerden Trizol kullanarak RNA izolasyonu ve izole edilen RNA'ların spektral analizi
3) Makromolekül RNA'nın izolasyon tipleri ve analiz yöntemleri; Memeli hücrelerinden TriPure kullanarak RNA izolasyonu ve izole edilen RNA'ların spektral analizi
4) Makromolekül RNA'nın elektroforetik analizi; RNA elektroforetik analizi, Nükleik asitlerin hibridizasyon yöntemleri (Northern blotlama, Southern Blotlama, FISH, ISH) teorik bilgi verilmesi, Bitki ve memeli hücrelerinden izole edilen toplam RNA izolatlarının elektroforetik analizi (MOPS jel elektroforezi), Jel elektroforez ve spektrofotometri sonuçlarının karşılaştırılması ve değerlendirilerek rapor olarak sunulması
5) Makromolekül RNA'nın işlenmesi ve kantifikasyonu; Memeli hücrelerinden izole edilen RNA'lardan cDNA sentez edilmesi, cDNA spektral analizi, farklı genomik bölgelere ait primerler ile cDNA PZR çoğaltılması, sonuçların agaroz jelde görüntülenmesi ile genomik ve cDNA PZR sonuçlarının kıyaslanması
6) Makromolekül RNA'nın işlenmesi ve kantifikasyonu; Kantitatif PZR analiz yöntemleri; Memeli cDNA'sı kullanılarak kantitatif PZR yöntemleri, kantitatif PZR sonuçlarının değerlendirilmesi ve rapor olarak sunulması
7) Proteinlerin izolasyon ve kantifikasyon yöntemleri; Bitkilerden toplam protein izolasyonu ve Bradford yöntemi ile kantifikasyonu
8) Proteinlerin izolasyon ve kantifikasyon yöntemleri; Memeli hücrelerinden toplam protein izolasyonu ve Bradford, Lowry yöntemleri ile kantifikasyon, sonuçların değerlendirilerek rapor olarak sunulması
9) Makromolekül olarak proteinlerin analizinde moleküler biyolojik teknikleri; Western blotlama;Memeli hücrelerinden izole edilen sitoplazmik ve mitokondriyal protein özütleri kullanılarak Western blotlama için SDS-PAGE yürütülmesi ve elektroblotlama
10) Protein elektroforez yöntemleri; SDS-PAGE, Jel boyama yöntemleri, İzoelektrik odaklama, 2D jel elektroforezi ve jel kurutma yöntemlerinin teorik olarak öğretilmesi, izole edilen proteinlerin SDS-PAGE jel elektroforezi ile yürütülmesi ve Coomassie boyama ve sonuçların değerlendirilerek rapor olarak sunulması
11) Proteinlerin konsantre edilme yöntemleri, kromatografinin genel prensipleri, hücre komponentlerinden protein izole edilmesi; Memeli hücrelerinden sitoplazmik ve mitokondriyal protein izole edilmesi, Bradford ile kantifikasyon
12) Makromolekül olarak proteinlerin analizinde moleküler biyolojik teknikleri; Mikroarray analizleri; Protein mikroarrayleri; EMSA, Mikrosekuanslama, DNA footprinting yöntemlerinin teorik olarak öğrenilmesi, Western blotlama sonuçların değerlendirilmesi ve rapor olarak sunulması
13) Makromolekül olarak proteinlerin analizinde moleküler biyolojik teknikleri; ELISA yönteminin çalışma prensibinin ve tiplerinin teorik olarak öğretilmesi, serum örneklerinde ELISA yöntemi ile protein konsantrasyon hesaplanmasının öğrenilmesi, sonuçların rapor olarak verilmesi, Moleküler biyoloji teknikleri dersi kapsamında işlenen tekniklerin moleküler biyoloji ile ilgili çalışmalarda kullanımlarının incelenmesine yönelik öğrenci araştırma sunumları
14) Sunum
15) Sunum
16) Sunum

Önerilen/İstenen Ders Kaynakları

Planlanan Öğrenim Faaliyetleri Ve Eğitim Yöntemi

1) Anlatım
2) Soru-Cevap
3) Tartışma
4) Alıştırma ve Uygulama
5) Laboratuvar/Çalıştay

Değerlendirme Yöntemi ve Ölçütleri

Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarıya Oranı	30%
Sayı Yüzde Yarıyıl İçi Çalışmaları Ara Sınav 1 40% Uygulama 1 30% Proje 1 30%
Yarıyıl Sonu Sınavının Başarıya Oranı	70%
Toplam	100%

Dersin Eğitim Dili

Türkçe

Mesleki Uygulama

İstenmemekte